Dinámica de la transmisión del SARS-CoV-2 en España

Periodismo científico. Tarea 6.1.- Análisis sobre la cobertura informativa de un preprint

En esta tarea debemos razonar si decidimos escribir o no una pieza periodística a partir de un manuscrito subido a la plataforma de prepublicaciones BiorXiv.

El artículo “Phylodynamics of SARS-CoV-2 transmission in Spain” analiza el origen y la difusión del SARS-CoV-2 en España y Europa a partir del análisis de la secuencia completa del genoma del virus en más de 1500 muestras depositadas en la base de datos GISAID. El tema es de gran interés e impacto para la población en la situación de pandemia en la que se depositó el artículo (abril de 2020), máxime teniendo en cuenta que muchas políticas sanitarias podrían haberse tomado en función de estudios como este. 

 


La primera impresión que me da el artículo a la hora de evaluar su calidad y rigor científico es buena. Presenta una lista de autores con afiliaciones de confianza, todas ellas integradas en el Instituto de Salud Carlos III. Además, los dos autores principales, Francisco Díez-Fuertes y María Iglesias-Caballero, están registrados en ORCID. Y en el caso de Francisco Díez-Fuertes puede comprobarse que ha publicado en revistas de gran prestigio e impacto como Nature Communications. Otro argumento que me hace confiar en el buen hacer de los autores es la bibliografía. A lo largo del texto existen numerosas referencias que corroboran sus declaraciones o que amplían la información que proporcionan. Solo he encontrado una declaración a la que habría acompañado de una referencia, se trata de:

“The present study dated the tMRCA of this clade on January 19, 2020, which is clearly compatible with the epidemiologic information”

Que puede leerse en el último párrafo de la página 5. Si hubieran aportado una cita que describiera la información epidemiológica, lo habría agradecido.

Por otra parte, las herramientas de análisis que utilizan los autores en su estudio están indicadas en los lugares de interés, y también aportan las referencias necesarias para consultarlas. Por ejemplo, utilizan la base de datos GISAID que proporciona acceso abierto a datos genómicos del SARS-CoV-2. Además, allá donde no hay referencias porque el trabajo es de producción propia, los autores se apoyan en figuras. Eso sí, son demasiado pequeñas.

Otro magnífico indicador de la calidad científica del trabajo es la honestidad de los autores a la hora de resaltar las limitaciones del estudio, que describen con gran detalle en el último párrafo del manuscrito. Los autores también han depositado los datos de que disponían en la base de datos GISAID, lo que me induce a pensar que su disponibilidad para contrastar los datos es absoluta.

Por todas estas razones, decidiría recomendar a mis superiores una pieza periodística con esta información. Para contrastarla, intentaría contactar a uno de los dos autores principales del manuscrito y a una persona experta en análisis bayesiano, además de alguna otra persona experta en filogenética. Para asegurar la veracidad de mi pieza, buscaría a alguien cuyas investigaciones no presentaran conflictos de interés con las de los autores del manuscrito.

Nota de la autora

He escrito esta argumentación asumiendo que he accedido a la prepublicación poco después de que se subiera a BiorXiv. En este supuesto, con la información de la que dispongo y una pandemia en auge, sí decido escribir una recomendación. 

Pero debo hacer notar que, a día de hoy, no sé si estaría tan segura de querer hacer una pieza periodística con el manuscrito original. La razón es que el artículo se ha publicado hace poco en la revista Journal of Virology y el número de genomas secuenciados utilizados es mucho mayor, lo que me hace pensar que los problemas con la metodología que los autores reportaban con gran honestidad en el manuscrito original eran lo suficientemente importantes como para cuestionar la fiabilidad de los resultados.

Referencias

Díez-Fuertes, Francisco et al., Phylodinamics of SARS-CoV-2 transmission in Spain. https://doi.org/10.1101/2020.04.20.050039

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